בית הספר "תורת הנפש" מקיים ימי לימוד ועיון בתחום הנפש על פי תורת הבעל שם טוב  "הפסיכולוגיה היהודית" המקורית. תורה זו, שיסודותיה בתורת הקבלה, הלכה והתפתחה במשך השנים בהגותם של גדולי החסידות. בשנים האחרונות זוכה תורה זו לשפה חדשה ועכשווית בעזרת הפרשנות של הרב יצחק גינזבורג, ובכך נפתחה הדרך להכוונה טיפולית שיסודותיה בקודש